Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF330Q9Y3S2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF330Q9Y3S2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms