Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
REXO2Q9Y3B8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
REXO2Q9Y3B8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms