Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBE2D4Q9Y2X8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D4Q9Y2X8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms