Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC2Q9Y235 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC2Q9Y235 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC2Q9Y235 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms