Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HPS5Q9UPZ3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HPS5Q9UPZ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HPS5Q9UPZ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms