Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM33Q9UPN9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms