Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRID1Q9ULK0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GRID1Q9ULK0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRID1Q9ULK0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms