Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH7Q9ULB5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms