Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PNMA3Q9UL41 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PNMA3Q9UL41 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PNMA3Q9UL41 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms