Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATPIF1Q9UII2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATPIF1Q9UII2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms