Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMPXQ9UHP9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPXQ9UHP9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms