Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP25Q9UHP3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP25Q9UHP3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP25Q9UHP3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms