Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCF2Q9UG63 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCF2Q9UG63 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms