Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms