Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD4Q9NZQ9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMOD4Q9NZQ9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD4Q9NZQ9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD4Q9NZQ9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD4Q9NZQ9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD4Q9NZQ9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD4Q9NZQ9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD4Q9NZQ9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD4Q9NZQ9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD4Q9NZQ9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD4Q9NZQ9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD4Q9NZQ9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD4Q9NZQ9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD4Q9NZQ9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMOD4Q9NZQ9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
TMOD4Q9NZQ9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMOD4Q9NZQ9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMOD4Q9NZQ9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD4Q9NZQ9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD4Q9NZQ9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD4Q9NZQ9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD4Q9NZQ9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD4Q9NZQ9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD4Q9NZQ9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD4Q9NZQ9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD4Q9NZQ9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
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