Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ0

DNAJC27, DnaJ homolog subfamily C member 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC27Q9NZQ0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DNAJC27Q9NZQ0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJC27Q9NZQ0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms