Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VNN3Q9NY84 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VNN3Q9NY84 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VNN3Q9NY84 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms