Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB20Q9NX57 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB20Q9NX57 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms