Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT84Q9NSB2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT84Q9NSB2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms