Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CCL28Q9NRJ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCL28Q9NRJ3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCL28Q9NRJ3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCL28Q9NRJ3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCL28Q9NRJ3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCL28Q9NRJ3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCL28Q9NRJ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL28Q9NRJ3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL28Q9NRJ3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL28Q9NRJ3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL28Q9NRJ3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL28Q9NRJ3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL28Q9NRJ3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL28Q9NRJ3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL28Q9NRJ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL28Q9NRJ3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL28Q9NRJ3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL28Q9NRJ3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL28Q9NRJ3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL28Q9NRJ3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL28Q9NRJ3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL28Q9NRJ3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms