Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SAR1AQ9NR31 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAR1AQ9NR31 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms