Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEC31BQ9NQW1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEC31BQ9NQW1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SEC31BQ9NQW1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms