Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSCN3Q9NQT6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms