Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NPHS2Q9NP85 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPHS2Q9NP85 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms