Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ2

LRRC4C, Leucine-rich repeat-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4CQ9HCJ2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC4CQ9HCJ2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4CQ9HCJ2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms