Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC96

CAPN10, Calpain-10, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN10Q9HC96 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN10Q9HC96 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN10Q9HC96 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms