Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC86Q9H6F5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC86Q9H6F5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC86Q9H6F5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC86Q9H6F5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC86Q9H6F5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC86Q9H6F5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC86Q9H6F5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC86Q9H6F5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC86Q9H6F5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC86Q9H6F5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC86Q9H6F5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC86Q9H6F5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC86Q9H6F5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC86Q9H6F5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC86Q9H6F5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC86Q9H6F5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC86Q9H6F5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC86Q9H6F5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC86Q9H6F5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC86Q9H6F5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC86Q9H6F5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC86Q9H6F5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC86Q9H6F5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC86Q9H6F5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms