Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00597Q9H2U6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00597Q9H2U6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms