Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC39A8Q9C0K1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms