Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL4Q9C0H6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL4Q9C0H6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms