Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHANK3Q9BYB0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SHANK3Q9BYB0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHANK3Q9BYB0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHANK3Q9BYB0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHANK3Q9BYB0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SHANK3Q9BYB0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SHANK3Q9BYB0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SHANK3Q9BYB0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SHANK3Q9BYB0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SHANK3Q9BYB0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms