Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC46A2Q9BY10 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC46A2Q9BY10 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms