Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RNF17Q9BXT8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RNF17Q9BXT8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RNF17Q9BXT8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms