Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
HIRIP3Q9BW71 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC31.87■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
HIRIP3Q9BW71 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms