Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB2BQ9BVA1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB2BQ9BVA1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB2BQ9BVA1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms