Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRADC1Q9BSG0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRADC1Q9BSG0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms