Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM7Q9BQ49 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM7Q9BQ49 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms