Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLF6Q99612 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF6Q99612 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF6Q99612 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms