Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PNKPQ96T60 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNKPQ96T60 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms