Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
RSF1Q96T23 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
RSF1Q96T23 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC40.12■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC40.1■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
RSF1Q96T23 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
RSF1Q96T23 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
RSF1Q96T23 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
RSF1Q96T23 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
RSF1Q96T23 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
RSF1Q96T23 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC40.07■■■■■ 4
RSF1Q96T23 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
RSF1Q96T23 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
RSF1Q96T23 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
RSF1Q96T23 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
RSF1Q96T23 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
RSF1Q96T23 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
RSF1Q96T23 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
RSF1Q96T23 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
RSF1Q96T23 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
RSF1Q96T23 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms