Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRBNQ96SW2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CRBNQ96SW2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms