Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CSRNP1Q96S65 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP1Q96S65 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms