Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CICQ96RK0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CICQ96RK0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CICQ96RK0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms