Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HHIPQ96QV1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HHIPQ96QV1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms