Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GBP4Q96PP9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP4Q96PP9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms