Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC138Q96M89 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC138Q96M89 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms