Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGED4Q96JG8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAGED4Q96JG8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms