Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LINGO1Q96FE5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LINGO1Q96FE5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms