Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RNFT2Q96EX2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms