Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIFAQ96CG3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TIFAQ96CG3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TIFAQ96CG3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.3 ms